Selv om Ny Alliance ikke har nogen formuleret kirkepolitik, kommer partiet nu med et kirkepolitisk udspil.

Til Kristeligt Dagblad (3.11.2007) siger Naser Khader – der som muslim ikke er medlem af Folkekirken – at Folkekirkens medlemmer skal vælge biskopperne direkte, og at biskopperne skal ansættes for en begrænset periode.

Overfor Kristeligt Dagblad (3.11.2007) kritiserer SF’s kirkeordfører, Pernille Vigsø Bagge, Ny Alliances forslag for at være poppet. Hun mener at politikerne skal Få danskere til at interessere sig for valgene til menighedsrådene, fremfor at udhule rådenes betydning.